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多種養(yǎng)殖哺乳動(dòng)物攜帶的病毒基因組遺傳多樣性被解碼
[所屬分類:行業(yè)動(dòng)態(tài)] [發(fā)布時(shí)間:2024-9-11] [發(fā)布人:楊曉燕] [閱讀次數(shù):] [返回]
多種養(yǎng)殖哺乳動(dòng)物攜帶的病毒基因組遺傳多樣性被解碼
作者：江慶齡 來源：科學(xué)網(wǎng)
山東拓普生物工程有限公司 http://www.jinhuabanruo.cn
復(fù)旦大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院教授粟碩團(tuán)隊(duì)與中國科學(xué)院微生物研究所研究員畢玉海等合作者，揭示了多種哺乳動(dòng)物宏基因組數(shù)據(jù)中的病毒基因組組成、生態(tài)學(xué)特征與潛在跨物種傳播風(fēng)險(xiǎn)，為構(gòu)建“人-動(dòng)物-環(huán)境”一體化、多維度新發(fā)傳染病預(yù)測(cè)預(yù)警體系奠定了重要數(shù)據(jù)基礎(chǔ)。9月4日，相關(guān)研究發(fā)表于《自然》。
21世紀(jì)以來，人類多次經(jīng)歷由動(dòng)物源新發(fā)傳染病原引發(fā)的大流行疫情。據(jù)報(bào)道，超過70%的人畜共患疾病源自野生動(dòng)物。同時(shí)國內(nèi)外大量研究提示，部分養(yǎng)殖哺乳動(dòng)物如水貂等可能具有攜帶人獸共患病毒的潛力。然而除傳統(tǒng)家畜外，養(yǎng)殖哺乳動(dòng)物的病原生態(tài)學(xué)與流行病學(xué)數(shù)據(jù)存在較大空白，制約了新發(fā)傳染病疫情的精準(zhǔn)防控。
研究團(tuán)隊(duì)對(duì)5個(gè)動(dòng)物目的哺乳動(dòng)物進(jìn)行了系統(tǒng)的宏基因組研究，鑒定到125種病毒基因組，其中39種可推定為新的病毒種。進(jìn)一步地，研究人員遴選出諾如病毒、蓋塔病毒等多種頻繁發(fā)生“宿主跳躍”的潛在“風(fēng)險(xiǎn)”病毒，對(duì)其潛在跨物種傳播風(fēng)險(xiǎn)進(jìn)行解析，并從空間聚類、動(dòng)物類群、種群、組織等維度揭示了這些病毒的生態(tài)學(xué)與流行病學(xué)特征。
為在個(gè)體水平解析病毒共感染，同時(shí)更靈敏地挖掘低豐度病毒，團(tuán)隊(duì)設(shè)計(jì)了單組織單樣本的建庫策略，在166個(gè)單組織文庫里鑒定到2種以上病毒。結(jié)果表明，星狀病毒、細(xì)小病毒等與其他病毒頻繁發(fā)生共感染。此外，研究人員對(duì)低豐度病毒片段進(jìn)行精準(zhǔn)拼接，避免了真陽性病毒因豐度閾值而被過濾，實(shí)現(xiàn)了多個(gè)病毒基因組90%的完成度。
“我們希望填補(bǔ)當(dāng)前對(duì)動(dòng)物攜帶微生物的認(rèn)知空白，尤其是養(yǎng)殖哺乳動(dòng)物�！彼诖T表示，“如果能提前監(jiān)測(cè)和預(yù)報(bào)對(duì)人類和家畜構(gòu)成潛在威脅的病毒，并部署包括動(dòng)物疫苗研發(fā)在內(nèi)的綜合防控措施，將對(duì)于新發(fā)傳染病關(guān)口前移、保障生命健康至關(guān)重要�！�
相關(guān)論文信息：https://doi.org/10.1038/s41586-024-07901-3
（本文內(nèi)容來源于網(wǎng)絡(luò)，版權(quán)歸原作者所有，如有侵權(quán)可后臺(tái)聯(lián)系刪除。）
作者：江慶齡 來源：科學(xué)網(wǎng)
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復(fù)旦大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院教授粟碩團(tuán)隊(duì)與中國科學(xué)院微生物研究所研究員畢玉海等合作者，揭示了多種哺乳動(dòng)物宏基因組數(shù)據(jù)中的病毒基因組組成、生態(tài)學(xué)特征與潛在跨物種傳播風(fēng)險(xiǎn)，為構(gòu)建“人-動(dòng)物-環(huán)境”一體化、多維度新發(fā)傳染病預(yù)測(cè)預(yù)警體系奠定了重要數(shù)據(jù)基礎(chǔ)。9月4日，相關(guān)研究發(fā)表于《自然》。
21世紀(jì)以來，人類多次經(jīng)歷由動(dòng)物源新發(fā)傳染病原引發(fā)的大流行疫情。據(jù)報(bào)道，超過70%的人畜共患疾病源自野生動(dòng)物。同時(shí)國內(nèi)外大量研究提示，部分養(yǎng)殖哺乳動(dòng)物如水貂等可能具有攜帶人獸共患病毒的潛力。然而除傳統(tǒng)家畜外，養(yǎng)殖哺乳動(dòng)物的病原生態(tài)學(xué)與流行病學(xué)數(shù)據(jù)存在較大空白，制約了新發(fā)傳染病疫情的精準(zhǔn)防控。
研究團(tuán)隊(duì)對(duì)5個(gè)動(dòng)物目的哺乳動(dòng)物進(jìn)行了系統(tǒng)的宏基因組研究，鑒定到125種病毒基因組，其中39種可推定為新的病毒種。進(jìn)一步地，研究人員遴選出諾如病毒、蓋塔病毒等多種頻繁發(fā)生“宿主跳躍”的潛在“風(fēng)險(xiǎn)”病毒，對(duì)其潛在跨物種傳播風(fēng)險(xiǎn)進(jìn)行解析，并從空間聚類、動(dòng)物類群、種群、組織等維度揭示了這些病毒的生態(tài)學(xué)與流行病學(xué)特征。
為在個(gè)體水平解析病毒共感染，同時(shí)更靈敏地挖掘低豐度病毒，團(tuán)隊(duì)設(shè)計(jì)了單組織單樣本的建庫策略，在166個(gè)單組織文庫里鑒定到2種以上病毒。結(jié)果表明，星狀病毒、細(xì)小病毒等與其他病毒頻繁發(fā)生共感染。此外，研究人員對(duì)低豐度病毒片段進(jìn)行精準(zhǔn)拼接，避免了真陽性病毒因豐度閾值而被過濾，實(shí)現(xiàn)了多個(gè)病毒基因組90%的完成度。
“我們希望填補(bǔ)當(dāng)前對(duì)動(dòng)物攜帶微生物的認(rèn)知空白，尤其是養(yǎng)殖哺乳動(dòng)物�！彼诖T表示，“如果能提前監(jiān)測(cè)和預(yù)報(bào)對(duì)人類和家畜構(gòu)成潛在威脅的病毒，并部署包括動(dòng)物疫苗研發(fā)在內(nèi)的綜合防控措施，將對(duì)于新發(fā)傳染病關(guān)口前移、保障生命健康至關(guān)重要�！�
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