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中國蛇類DNA條形碼參考數(shù)據(jù)集發(fā)布
中國蛇類DNA條形碼參考數(shù)據(jù)集發(fā)布
作者:沈春蕾 來源:中國科學(xué)報(bào)
山東拓普生物工程有限公司 http://www.jinhuabanruo.cn
中國科學(xué)院昆明動物研究所(以下簡稱昆明動物所)研究員車靜課題組聯(lián)合國內(nèi)科研團(tuán)隊(duì)開展合作,首次系統(tǒng)性構(gòu)建了中國蛇類DNA條形碼參考數(shù)據(jù)集(COI),對中國蛇類多樣性進(jìn)行了評估。日前,相關(guān)研究成果發(fā)表于《分子生態(tài)學(xué)資源》(Molecular Ecology Resources)。據(jù)了解,兩棲爬行動物總體形態(tài)較保守且存在趨同現(xiàn)象,給傳統(tǒng)分類帶來了困難,僅僅使用形態(tài)學(xué)的鑒定標(biāo)準(zhǔn)極大地影響了對其物種多樣性的正確評估。DNA條形碼技術(shù)采用數(shù)字化形式,使樣本鑒定過程能夠?qū)崿F(xiàn)自動化和標(biāo)準(zhǔn)化,突破了對傳統(tǒng)形態(tài)經(jīng)驗(yàn)的過度依賴,不受生物體發(fā)育階段的限制,彌補(bǔ)傳統(tǒng)形態(tài)學(xué)鑒定方法的不足!癉NA條形碼技術(shù)與傳統(tǒng)形態(tài)學(xué)分類方法相結(jié)合不僅可以快速、準(zhǔn)確的對物種進(jìn)行鑒定和分類,還可能發(fā)現(xiàn)許多潛在的物種。”車靜告訴《中國科學(xué)報(bào)》。作為全球范圍的兩棲爬行動物DNA條形碼“COLDCODE”計(jì)劃發(fā)起團(tuán)隊(duì)之一,在前期對研究工作中,昆明動物所張亞平院士和車靜課題組已經(jīng)解決了兩棲爬行動物中COI引物擴(kuò)增較為困難的瓶頸問題,為“COLDCODE”計(jì)劃實(shí)施奠定了技術(shù)基礎(chǔ)。 此次基于系統(tǒng)的野外考察和長期的積累,車靜等人的研究涉及228個(gè)已知物種,占已描述物種的80.6%,覆蓋了中國大部分區(qū)域。研究表明,中國蛇類物種多樣性被低估,保守估計(jì)中國蛇類存在至少36個(gè)未被描述的新種。該研究還揭示DNA條形碼能夠有效鑒定大部分的中國蛇類到物種水平,但是對于存在分類爭議、不完全譜系分選、基因漸滲和復(fù)雜的物種形成及分化機(jī)制等類群,DNA條形碼表現(xiàn)出較低的識別效率!吨袊茖W(xué)報(bào)》從昆明動物所獲悉,中國具有豐富的蛇類物種多樣性,已知現(xiàn)存的蛇類有283種,隸屬18科65屬(截至2020年12月31日),占世界總蛇類種數(shù)的8%左右,并且中國蛇類物種數(shù)量仍然在不斷增加。近幾十年來,由于對蛇類資源的過度開發(fā)利用,加之棲息地遭破壞、非法的收集和蛇類貿(mào)易等,中國蛇類面臨嚴(yán)重的威脅,其中有2種極危蛇種、4種瀕危蛇種,18種易危和近危蛇種。同時(shí),蛇類具有重要的應(yīng)用價(jià)值,自古以來被人類所食用、藥用以及作為化工原料,其中蛇毒是極為珍貴的藥物原料,在醫(yī)藥領(lǐng)域中有很大的利用價(jià)值。車靜說:“我們的研究構(gòu)建的DNA條形碼參考數(shù)據(jù)集為中國蛇類研究、資源保護(hù)和監(jiān)管提供了重要的科學(xué)數(shù)據(jù)支撐。”
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